Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPDC1A2A3K4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms