Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCML1Q9UN30 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms