Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
POLKQ9UBT6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms