Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms