Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP35Q9P2H5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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USP35Q9P2H5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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