Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC88CQ9P219 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC88CQ9P219 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms