Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HACD3Q9P035 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms