Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXC10Q9NYD6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXC10Q9NYD6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
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