Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM248Q9NWD8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms