Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ABCC13Q9NSE7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms