Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOPCQ9HD26 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GOPCQ9HD26 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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