Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COG4Q9H9E3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms