Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KDM5DQ9BY66 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5DQ9BY66 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms