Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RHOXF2Q9BQY4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOXF2Q9BQY4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms