Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms