Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG3Q96JB2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms