Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAVIN3Q969G5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAVIN3Q969G5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms