Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SELENOMQ8WWX9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms