Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF4Q8WV16 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms