Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAG1Q86YV5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAG1Q86YV5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms