Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HDXQ7Z353 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms