Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDZRN4Q6ZMN7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDZRN4Q6ZMN7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms