Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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