Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FAM208BQ5VWN6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms