Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D3Q587I9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms