Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC93Q567U6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms