Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A12Q504Y0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms