Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN3Q4LDR2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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