Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDO1Q16878 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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