Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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LTC4SQ16873 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LTC4SQ16873 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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