Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DUSP6Q16828 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DUSP6Q16828 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms