Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RTN1Q16799 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RTN1Q16799 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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RTN1Q16799 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RTN1Q16799 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RTN1Q16799 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RTN1Q16799 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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