Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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PCSK7Q16549 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK7Q16549 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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