Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SSX1Q16384 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms