Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms