Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
GRK1Q15835 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms