Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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