Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL807742.1-201ENST00000636678 1160 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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