Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PDCD1Q15116 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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