Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
R3HDM1Q15032 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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