Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NFIXQ14938 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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