Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms