Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PKP1Q13835 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PKP1Q13835 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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