Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LAMC2Q13753 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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