Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms