Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TOP3AQ13472 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms