Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AL358176.4-201ENST00000428891 675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC092718.5-201ENST00000562450 593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDAP1Q13442 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PDAP1Q13442 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms