Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PTGDRQ13258 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTGDRQ13258 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTGDRQ13258 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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