Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HSPB3Q12988 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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