Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXC1Q12948 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXC1Q12948 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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